در اجرای نامه شماره 1026/100 مورخ 94/11/3 وزیر محترم وقت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی و با توجه به نقش برنامه‌ریزی اعم از راهبردی و عملیاتی در تحقق اهداف نظام سلامت و تکالیف وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی در اسناد فرادست که مستلزم نقش‌آفرینی و مشارکت حداکثری دانشگاه‌های علوم پزشکی است، به منظور اطمینان از طراحی و پیاده‌سازی نظام برنامه‌ریزی در دانشگاه‌های علوم پزشکی و همچنین هماهنگی و همسویی حداکثری دانشگاه‌های علوم پزشکی با ستاد وزارتخانه، مسئولیت راهبری و نظارت کلان بر فرایندهای برنامه‌ریزی بر عهده «قائم‌مقام هر دانشگاه در امور برنامه‌ریزی» قرار داده شد.

با توجه به ادغام دو معاونت «توسعه مدیریت و منابع» و «برنامه‌ریزی، راهبردی و هماهنگی » و تشکیل معاونت «توسعه مدیریت، منابع و برنامه‌ریزی»، انتظار می‌رود معاونین محترم توسعه مدیریت و منابع دانشگاه‌های علوم پزشکی به عنوان معاونین متناظر دانشگاهی این معاونت، مسئولیت یادشده را عهده‌دار شوند.